home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Arsenal Files 6 / The Arsenal Files 6 (Arsenal Computer).ISO / health / med9605a.zip / M9650079.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-03-09  |  3KB  |  44 lines
  1.        Document 0079
  2.  DOCN  M9650079
  3.  TI    Variable efficiency of three primer pairs for the diagnosis of
  4.        Pneumocystis carinii pneumonia by the polymerase chain reaction.
  5.  DT    9605
  6.  AU    De Luca A; Tamburrini E; Ortona E; Mencarini P; Margutti P; Antinori A;
  7.        Visconti E; Siracusano A; Institute of Clinical Infectious Diseases,
  8.        Catholic University,; Rome, Italy.
  9.  SO    Mol Cell Probes. 1995 Oct;9(5):333-40. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/96123416
  11.  AB    The efficiency of three different primer pairs, complementary to
  12.        different Pneumocystis carinii DNA regions, was compared in the
  13.        polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of Pneumocystis
  14.        carinii pneumonia (PCP) on bronchoalveolar fluid (BALF) from patients
  15.        with AIDS. PCR coupled with dot-blot hybridization (BLOT) using primers
  16.        and probe from the mitochondrial 23SrDNA region showed the highest
  17.        sensitivity, with a lower detection limit of 0.5-1 organisms
  18.        microliter-1. When testing 47 BALF, PCR plus BLOT of the mitochondrial
  19.        23SrDNA region showed also the best diagnostic efficiency (97%
  20.        sensitivity, 100% specificity). Sensitivity was significantly higher
  21.        than with PCR and BLOT of the 5SrDNA region (81.5% sensitivity; P =
  22.        0.025, McNemar test); and of the dehydrofolate reductase (DHFR) gene
  23.        region (75.6% sensitivity; P = 0.019). Sensitivity was also
  24.        significantly higher than indirect immunofluorescence (75.8%
  25.        sensitivity; P = 0.008). Using DHFR primers and probe, specificity was
  26.        also reduced. The diagnostic sensitivity in clinical specimens
  27.        paralleled the detection limit in the standard dilutions. The use of
  28.        repeated DNA sequences of proven specificity as target of PCR
  29.        amplification favourably influences sensitivity and specificity. This
  30.        comparative study demonstrates that primer selection plays a significant
  31.        role in the diagnosis of PCP by PCR.
  32.  DE    AIDS-Related Opportunistic Infections/*DIAGNOSIS  Base Sequence
  33.        Comparative Study  DNA Primers  DNA, Mitochondrial/GENETICS  DNA,
  34.        Ribosomal/GENETICS  Human  In Situ Hybridization  Molecular Sequence
  35.        Data  Oligonucleotide Probes  Pneumocystis carinii/GENETICS/*ISOLATION &
  36.        PURIF  Pneumonia, Pneumocystis carinii/*DIAGNOSIS  *Polymerase Chain
  37.        Reaction  Reproducibility of Results  RNA, Ribosomal, 23S/GENETICS  RNA,
  38.        Ribosomal, 5S/GENETICS  Support, Non-U.S. Gov't  Tetrahydrofolate
  39.        Dehydrogenase/GENETICS  JOURNAL ARTICLE
  40.  
  41.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  42.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  43.  
  44.